Ośrodek "Pogranicze - sztuk, kultur, narodów" w Sejnach został powołany do istnienia w styczniu 1991 roku, przez ówczesnego wojewodę suwalskiego Franciszka Wasika.         

Od początku swego istnienia Ośrodek uzyskał także bardzo istotne wsparcie ze strony władz miasta Sejny, co się wyraziło m.in. w przekazaniu jego pracownikom mieszkań komunalnych i budynków w użytkowanie. Obecnie w trzech budynkach, Domu Pogranicza, Dawnej Jesziwie i Białej Synagodze, prowadzonych jest szereg pracowni i programów edukacyjnych, artystycznych, wystawienniczych, animacyjnych i badawczych, których obszar zainteresowania rozciąga się od zagadnień lokalnych, przez regionalne, po ogólnoeuropejskie i światowe.